协助调查时扣留手机的时间限制如下：
警方在查案时，如果怀疑手机里有跟案件相关的信息或证据，有权暂扣协助人的手机。暂扣的时间通常是24小时，最长可以延长到48小时，但这一延长需要经过县级及以上公安机关的批准。
在行政案件中，扣押期限一般为30日，若情况复杂，经县级以上公安机关负责人批准，可以延长30日。若手机与案件无关，则应在三日内解除扣押。
对于刑事案件，虽然《刑事诉讼法》未设明确期限，但一旦确认手机与案件无关，必须在三个工作日内解除扣押。
若手机信息对破案至关重要，扣留时间可能长达数月。在这种情况下，扣留时间取决于案件的调查进度和取证需要。
综上所述，协助调查时扣留手机的时间一般为24小时至48小时，特殊情况可延长，但需经过相关审批。若手机与案件无关，则应在三日内解除扣押并归还给当事人。
