工程合同违约的诉讼时效为 三年，从权利人知道或应当知道权利受到损害及义务人之日起计算。如果超过二十年，法院将不予保护，但特殊情况下可以申请延长。
需要注意的是，诉讼时效期间的中断可以重新计算。例如，当权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行义务、权利人提起诉讼或申请仲裁等情况时，诉讼时效会中断并重新计算。
此外，对于工程质量缺陷的争议，诉讼时效自阶段质量验收发现缺陷或阶段质量验收未通过时起算，如果质量缺陷争议已委托鉴定，则自鉴定单位出具鉴定意见后二年。
因此，在工程合同违约的情况下，建议尽早采取行动，以免因超过诉讼时效而丧失法律保护的权利。
